Por parte de la Comisión de Vigilancia del Financiamiento Público y Privado de los Partidos Políticos, se crearon los “Lineamientos, Formatos e Instructivos que deberán ser utilizados por los partidos políticos y coaliciones en la presentación de sus Informes Anuales y de Campaña”, con la finalidad de establecer reglas claras que estimulan la transparencia en la aplicación de los recursos públicos y privados de los partidos políticos como entidades de interés público, mismos que fueron actualizados en dos ocasiones, la primera en el año 2001, y una segunda ocasión en el 2004.
De igual manera, en el mes de diciembre del año 2001, se elaboraron los “Lineamientos para el Financiamiento Público por Actividades Extraordinarias realizadas por los partidos políticos”, con el fin de detallar claramente dichas actividades y la forma de reportarlos ante la autoridad electoral para dar cumplimiento a la ley electoral.
El 6 de febrero del 2002, se emitieron los “Lineamientos para el Uso de Tiempos Oficiales de los Partidos Políticos” y posteriormente fueron actualizados el 17 de noviembre de 2005. Estos detallan la forma en que los partidos políticos pueden utilizar de manera más eficiente esta prerrogativa que les otorga la ley electoral.
El 13 de junio del 2002 se aprobó el “Acuerdo de Transparencia de la CEE”, que establece la información a publicar tanto del propio organismo electoral como de los partidos políticos.
El 7 de octubre del 2002, se aprobaron los “Lineamientos para la Organización de Debates para el Proceso Electoral” del 2003 y el 17 de noviembre de 2005, fueron actualizados para el proceso electoral del 2006. Dichos lineamientos contienen las normas específicas en materia de logística y preparación de estos eventos por parte de la CEE y de las Comisiones Municipales Electorales.